La CNAMTS est un établissement public administratif, placé sous la double tutelle du ministère chargé de la Sécurité sociale et du ministère de l’Économie et des Finances.
Elle assure, pour les travailleurs salariés (et leurs ayants droit), le financement des assurances maladie, maternité, invalidité, décès, accident du travail et maladie professionnelle.
Elle définit, pour cela, les politiques de gestion du risque au niveau national, les grandes orientations de l’assurance maladie et les programmes de prévention de la maladie. Elle finance, par ailleurs, l’action sanitaire et sociale. Elle délègue la mise en œuvre au réseau des caisses primaires d’Assurance maladie (CPAM).